Kloning och sekvensering av ett DNA fragment
Projektbeskrivning:
I vår forskning studerar vi växters försvarsreaktion mot bladlusangrepp. Vi har identifierad gener för vilka mängden av budbärar RNA ökar när växten angrips av bladlöss. En särskilt känslig reaktion, revers transkription-polymeras kedje reaktion (RT-PCR) med korta syntetiska DNA molekyler som är genspecifika används för att mäta dessa skillnader. För att testa specifiteten tar man fram sekvensen av det fragment som erhålls med RT-PCR. I projektet kommer du att genomföra RT-PCR för en gen vars uttryck förändras under bladlusangrepp. PCR-produkten kommer du att klona och sekvensera sedan sätta in det i en plasmid som du har förberedd genom klyvning med lämplig restriktionsenzym. Konstruktet kommer att överföras i bakterien Escherichia coli. Det rekombinanta DNA molekyl kommer du att rena upp från en bakteriekultur för sekvensbestämmning. På det sättet kan man säkerställa att det fragment som man erhåller med RT-PCR överensstämmer med den RNA sekvensen som man ville amplifiera.
I vår forskning studerar vi växters försvarsreaktion mot bladlusangrepp. Vi har identifierad gener för vilka mängden av budbärar RNA ökar när växten angrips av bladlöss. En särskilt känslig reaktion, revers transkription-polymeras kedje reaktion (RT-PCR) med korta syntetiska DNA molekyler som är genspecifika används för att mäta dessa skillnader. För att testa specifiteten tar man fram sekvensen av det fragment som erhålls med RT-PCR. I projektet kommer du att genomföra RT-PCR för en gen vars uttryck förändras under bladlusangrepp. PCR-produkten kommer du att klona och sekvensera sedan sätta in det i en plasmid som du har förberedd genom klyvning med lämplig restriktionsenzym. Konstruktet kommer att överföras i bakterien Escherichia coli. Det rekombinanta DNA molekyl kommer du att rena upp från en bakteriekultur för sekvensbestämmning. På det sättet kan man säkerställa att det fragment som man erhåller med RT-PCR överensstämmer med den RNA sekvensen som man ville amplifiera.
Projektet kan sökas:
Året om
Information om handledaren:
Gabriele Delp är Lektor i botanik vid Södertörns högskola
Svarar på frågor inom: växtbiologi
Kort presentation: ag är växtmolekylärbiolog med doktorsexamen från Tyskland. Jag ingår i Lisbeth Jonssons forskargrupp. Vår forskning är inriktat på växters försvarsreaktioner mot bladlusangrepp, växt-växt kommunikation och växters sekundärmetabolism.
Är du intresserad av det här projektet?
Skickat ett e-mail till Gabriele Delp via formuläret nedan
Är det verkligen bara att skicka ett e-mail, så kan jag göra projektet?
- JA, det är det! Visa ditt intresse är allt du behöver göra!
Observera att den här tjänsten är avsedd
främst för gymnasieelever vid svenska gymnasieskolor
Vi ber dig även att inte kontakta flera forskare samtidigt.
Hur kan ett e-mail se ut?